LC-MS 組織抗原識別
一、LC-MS背景介紹
T細胞受體(TCR)與人類白血球抗原(HLA)復合物呈現的肽段(peptide - HLA)的特異性識別,構成了人類T細胞免疫響應的核心機制。這種特異性識別對于抵御傳染病、調控自身免疫疾病、抗腫瘤作用以及腫瘤免疫治療至關重要。
HLA分為I類和II類兩大類:
- I類HLA廣泛表達于幾乎所有體細胞上,包括HLA - A,HLA - B,HLA - C,主要呈現長度為8至13個氨基酸的短肽;
- II類HLA主要在專職的抗原呈遞細胞上表達,包括HLA - DP、HLA - DQ、HLA - DR,呈現較長的肽段。
虎賁生物也提供HLA分型檢測,HLA 四聚體,點擊文字即可跳轉。
CD8+ T細胞通常識別由I類HLA呈遞的抗原,并在腫瘤免疫反應和病毒性疾病的免疫防御中,發揮著細胞毒性作用。研究HLA呈遞抗原,在基礎研究和臨床治療上都有重大意義。
HLA抗原的發現,與TCR測序的結合,在研發腫瘤特異性TCR中至關重要:
- 發現抗原肽后,可采用抗原肽對病人,健康人的血液進行刺激,以獲得高特異性T細胞。
- 抗原肽發現結合四聚體、多聚體的制備技術,可以快速完成從病人和健康人中篩選抗原特異性TCR。
- 對病人病灶組織和健康組織的檢測,能發掘該病人和該病人群體的特異性抗原,以及新抗原,為該病人和該類病人的治療方法提出指導和建議。
- 在細胞治療外,靶點的發現也能應用于腫瘤疫苗和其他關于自身免疫藥品的研發。
質譜抗原檢測法是目前最直觀,最真實的檢測法。相比起NGS結合軟件預測的方式, 質譜法的結果最可信也最精確。尤其是對于某個抗原,能直接體現其豐度,即細胞表面真實表達HLA - 抗原豐富程度。能極大的幫助研究者和醫生選擇更有可能成功的免疫治療方法。
此外,質譜法還能檢測到抗原的翻譯后修飾,如氧化,磷酸化,脲甲基化等,這些信息通過核酸測序無法獲取。
二、技術路線
左圖展示了通過液相色譜 - 質譜聯用技術(LC - MS)從細胞中提取并分析MHC(主要組織相容性復合體)肽配體的過程。整個流程可以分為幾個主要步驟:
組織細胞處理與裂解
- 細胞首先被清洗以去除組織間的雜蛋白和其他分子。
- 通過溫和的細胞裂解釋放細胞表面的pHLA。
免疫捕獲
- 使用特異性抗體固定在固相基質上來捕獲pHLA分子。有效地從復雜的細胞裂解液中富集pHLA分子。
- 經過多次清洗去除非特異性結合的蛋白質和雜質。
- 從固相基質中釋放pHLA。
去蛋白化與脫鹽
- MHC分子通常與肽配體及β2微球蛋白(β2M)復合體形式存在。分解蛋白質復合體,釋放肽配體。
- 去除樣本中的鹽分,為LC - MS分析做準備。
LC - MS分析
- 干凈的肽樣本通過色譜柱分離不同的肽段。
- 分離后的肽段被引入質譜儀進行質譜分析,檢測和識別肽段的質量和組成,通常結果以圖譜形式展示,每個峰代表一個特定的肽段。
三、結果展示
2016 Ablin et.al.Immumity
虎賁部分測試結果整理
虎賁生物醫療的抗原捕獲技術能有效捕獲85 - 90%的樣本抗原。
國際知名周刊上相關類似實驗,每樣本收獲數據量約為1000 - 3000條多肽。虎賁生物醫療每次收獲的多肽范圍是1300 - 4500條。
MS下機數據進行更進一步的分析驗證,確保每一條短肽的準確性。
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