HLA分型
一、HLA背景介紹
HLA（Human Leukocyte Antigen，人類白細胞抗原）是人類的主要組織相容性復合體（Major Histocompatibility Complex, MHC）表達的產(chǎn)物，其編碼的分子參與抗原遞呈，制約細胞間相互識別及誘導免疫應答。HLA分為3大類，即經(jīng)典HLA I類（HLA - A, B, C）、經(jīng)典HLA II類（HLA - DP, DQ, DR）以及非經(jīng)典HLA類。
HLA分子是人類多樣性最高的一組基因。其在人類個體中存在大量的多態(tài)性，以保證人類種群對各種病原體的廣泛適應性和抵抗力。HLA基因的繼承與表達關(guān)乎到我們健康相關(guān)的方方面面。某些HLA等位基因參與甚至導致自身免疫性疾病、過敏性疾病、感染類疾病、代謝性疾病等幾乎所有復雜疾病的發(fā)生、發(fā)展。例如，銀屑病與HLA - C*06:02，1型糖尿病與HLA - DQ2和HLA - DQ8，強直性脊柱炎和HLA - B27，類風濕關(guān)節(jié)炎與HLA - DR4，系統(tǒng)性紅斑狼瘡與HLA - DR3。
在免疫治療領域的科研工作者們可能更加關(guān)注HLA基因在治療中所扮演的角色。 一位病人的HLA分型不但影響Ta接受免疫治療的成功率；其HLA分型也決定Ta能不能采用一些高度個性化的細胞或抗體治療，比如TCR - T療法和TCRm - ADC等。因此在T細胞免疫的科學研究，和相關(guān)藥物研發(fā)中，供體的HLA基因型也是必須要了解的信息。
二、HLA命名規(guī)則
HLA基因的命名規(guī)則是HLA-基因名*血清學分型大類：蛋白大類：外顯子同義突變：內(nèi)含子和UTR突變。例如，HLA-A*01:01:01:01 和 HLA-A*01:01:02 所表達的蛋白完全一致，但是編碼蛋白的外顯子有同義突變。通常情況下在骨髓配型或者基因治療的領域，對于HLA分型的精確程度要求為4或6位（每一個數(shù)字記為1位），上述2個基因記為HLA-A*01:01:01和HLA-A*01:01:02 或者都屬于HLA-A*01:01。另有一些基因型含有字母，如N，S等，其代表不同含義。 如N代表編碼框移碼，該基因無法表達完整HLA蛋白。再如S表示，該HLA會以分泌，而不是膜蛋白的方式進行表達。
三、HLA多態(tài)性檢測方法
目前主流檢測HLA 分型的有3種方法
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基于一代Sanger測序的SBT分型法：
Sanger測序法是當代研究者認為的金標準。 方法是對HLA基因進行特異性擴增并采用一代測序分析其結(jié)果。該方法的優(yōu)點是高度準確。其準確性源于Sanger測序法本身99.99%的準確率。在需要檢測同一個的樣本的多個HLA分型時，工作量大，成本高。
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基于二代測序的NGS法：
NGS分型法同樣是基于對目標基因的富集，擴增和測序，采用算法進行拼接和比對。其優(yōu)勢在于擴增目標HLA基因后，進行NGS建庫。多位點的分型工作被簡化，檢測多個位點成本低廉。
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基于三代測序的分型法：
該技術(shù)目前受限于三代測序技術(shù)本身的成本問題，普及率較低。
四、算法優(yōu)勢
從2020年開始研發(fā)HLA分型法。在Sanger測序法上獲批發(fā)明專利。曾為多加企業(yè)和科研院校提供HLA分型服務，滿意度100%，無結(jié)果爭議?；①S同時擁有高效的NGS二代分型技術(shù)，測序精度高達6位，虎賁自主研發(fā)的算法，比傳統(tǒng)開源算法能極大提高準確率 （見實例）。通過同時擁有一代和二代分型法交叉驗證，可以保證極高的分型檢測準確率。
五、技術(shù)路線及價格
1．方法流程
2．檢測范圍
虎賁生物同時擁有高效的NGS二代分型技術(shù)，測序精度高達6位，有特別的科研需求可以精確到8位。通過同時擁有一代和二代分型法交叉驗證，可以保證極高的分型檢測準確率。
現(xiàn)提供基于NGS和SBT法的HLA分型服務。NGS法涵蓋可以涵蓋 HLA - A, B, C, DRB1, DQB1, DPB1, DQA1, DPA1, DRB3,4,5 等11 位點。 SBT法涵蓋HLA - A, B, C, DRB1, DQB1, DPB1等6位點。
- SBT 法分型 – 200/位點/樣本
- NGS法6位點（HLA - A, B, C, DRB1, DQB1, DPB1）分型 – 600元/樣本
- NGS法11位點（HLA - A, B, C, DRB1, DQB1, DPB1, DQA1, DPA1, DRB3,4,5）分型 - 750元/樣本
示例報告發(fā)明專利
